Application of computer-aided image analysis to studies of arbuscular endomycorrhizal fungi effects on plant root system morphology and dynamics

Abstract - Studies on the effects of arbuscular mycorrhizal (AM) fungi on plant root systems are frequently limited by the availability of techniques. The complex organisation of root systems and their inaccessibility below ground render it technically difficult to make accurate measurements of either root morphology or root dynamics. The 2 systems described both utilise image analysis. One makes possible detailed measurements of root morphology on harvestec root samples, permitting quantitative relationships between different hierarchical orders to be determined. The othe utilises a miniature colour television camera together with database software to make in situ measurements of root dynamics using minirhizotrons.

Résumé - Application de l'imagerie assistée par ordinateur aux études sur les effets des champignons endomycorhiziens arbusculaires sur la morphologie et la dynaique du système racinaire des plantes. Les études portant sur les effets des mycorhizes arbusculaires sur le système racinaire des plantes sont fréquemment limitées par la validité des techniques disponibles. L'organisation complexe des systèmes racinaires et leur inaccessibilité dans le sol rendent techniquement difficiles les mesures précises, à la fois de la morphologie et de la dynamique des racines. Les 2 systèmes décrits utilisent l'analyse par images. Le premier rend possible les détaillées de la morphologie sur des échantillons de racine prélevés, ce qui permet de déterminer des relations quantitatives entre les différents ordres hiérarchiques. Le second utilise une caméra video miniature en couleurs, associé à un logiciel de base de données pour faire, in situ, des mesures sur la dynamique racinaire en utilisant des minirhizotrons.