| Issue |
Agronomie
Volume 20, Number 2, March 2000
|
|
|---|---|---|
| Page(s) | 233 - 240 | |
| DOI | https://doi.org/10.1051/agro:2000123 | |
DOI: 10.1051/agro:2000123
Agronomie 20 (2000) 233-240
Optimal population size for RFLP-assisted cultivar identification in alfalfa (Medicago sativa L.)
Paola Labombarda - Fulvio Pupilli - Sergio Arcioni
Istituto di Ricerche sul Miglioramento Genetico delle Piante Foraggere, via Madonna Alta 130,
06128, Perugia, Italy
(
Abstract:
The ability of RFLP markers to distinguish between 2 heterogeneous alfalfa ecotypes, "Vogherese" and
"Maremmana", was correlated with the number of plants sampled in either single-plant or bulk analyses.
Independent subsample populations of 20 and 50 plants were compared for variance component partitioning
and band frequencies in 20-, 50- and 100-plant subpopulations of Maremmana. Homogeneity within 3
independent bulks of the same size as given above was taken as a measure of bulk optimal size. A minimum
of 50 plants is required for both single-plant and bulk analyses; however, for a large majority of bands
analysed, no significant differences were detected for their frequency among populations of 20, 50 and 100
plants, with the exception of 6 bands out of 48. One ecotype-specific marker was found through bulk
analysis. Results are discussed in relation to the improvement of RFLP methodology for cultivar
identification in alfalfa.
Keywords:
Medicago sativa / RFLP/ cultivar identification
Résumé:
Taille de population optimale pour l'identification des cultivars par RFLP chez la luzerne
(Medicago sativa L.). La capacité des marqueurs RFLP de distinguer entre deux écotypes hétérogènes
de luzerne, " Vogherese " et " Maremmana ", a été comparée avec le nombre de plantes composant un
échantillon utilisé aussi bien pour l'analyse sur des plantes individuelles que sur des plantes en mélange
(" bulk "). La partition des composantes de la variance a été comparée dans des sous-échantillons de
populations indépendantes de 20 et 50 plantes, et les fréquences de bandes ont été aussi comparées dans
des sous-populations de Maremmana constituées par 20, 50 et 100 plantes. Le degré d'homogénéité révelé à
l'intérieur de 3 " bulks " indépendants, de tailles identiques à celles qui viennent d'être mentionnées,
a été pris comme mesure de la taille optimale du " bulk ". Un minimum de 50 plantes est nécessaire aussi
bien pour l'analyse sur plantes individuelles qu'en " bulk ", alors que pour la grande majorité des
bandes analysée, aucune différence significative de leur fréquence n'a été relevée entre les populations
de 20, 50 et 100 plantes, à l'exception de 6 bandes sur 48. Un marqueur spécifique d'un écotype a été
trouvé au moyen de l'analyse " bulk ". Les résultats sont discutés dans l'optique d'une amélioration de
la méthodologie RFLP servant à l'identification des cultivars chez la luzerne.
Mots clé :
Medicago sativa / RFLP / identification des cultivars
Correspondence and reprints: Fulvio Pupilli
f.pupilli@irmgpf.pg.cnr.it
Communicated by Mervyn Humphreys (Aberystwyth, UK)
Copyright INRA, EDP Sciences