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Volume 15, Number 7-8, 1995
Page(s) 491 - 494
Agronomie 15 (1995) 491-494
DOI: 10.1051/agro:19950719

Molecular analyses of the coat protein region of different viruses on Poaceae belonging to the Potyviridae

R. Götz, W. Huth and E. Maiss

Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft, Institut für Biochemie und Pflanzenvirologie, Messeweg 11-12, D-38104 Braunschweig, Germany

Abstract - The coat protein region of the RNA of 3 different viruses all infecting Poaceae and belonging to the family Potyviridae were analyzed. Brome streak mosaic virus (BrSMV) and Agropyron mosaic virus (AgMV) are described as mite-transmissible, while cocksfoot streak virus (CfSV) is transmissible by aphids. The coat protein is important for the transmission of Potyviridae and the degree of identity between their coat protein sequences is used to indicate a relationship within the Potyviridae. Alignments of the coat protein region of BrSMV and several other members of the Potyviridae show a homology of 47% to a mite-transmissible rymovirus, but only 23-30% to aphid-transmissible potyviruses. Alignments of CfSV and different aphid-transmissible potyviruses show about 50% homology, respectively. All these results agree with the classification of Potyviridae based on their coat protein region. Alignments of AgMV to mite-transmitted viruses show a homology of only about 25%. This means either a low relationship between mite-transmitted Potyviridae or AgMV is possibly not transmissible by mites.

Résumé - Analyse moléculaire de la région de la protéine capside de divers virus appartenant aux Potyviridae et infectant les poacées. La région de la protéine capside du RNA de 3 virus différents infectant les poacées et appartenant à la famille des Potyviridae a été analysée. Le virus de la mosaïque striée du brome (BrSMV) et le virus de la mosaïque du chiendent (AgMV) sont transmis par acariens, alors que le virus de la striure du dactyle (CfSV) est transmis par aphides. La protéine capside est importante pour la transmission des Potyviridae et le degré de similitude entre les séquences de leurs protéines capside est utilisé pour évaluer les relations entre ces virus. La comparaison des séquences des régions de la protéine capside du BrSMV révèle une homologie de 47% avec celle d'un rymovirus transmissible par acariens, mais seulement 23-30% avec des potyvirus transmissibles par aphides. Entre le CfSV et différents potyvirus transmissibles par aphides, la comparaison révèle une homologie de 50% environ. Tous ces résultats sont en accord avec la classification des Potyviridae basée sur la région couvrant la protéine capside. La comparaison de l'AgMV à des virus transmissibles par les acariens révèle une homologie de seulement 25%. Cela signifie soit une faible parenté entre les Potyviridae transmissibles par acariens, soit que l'AgMV n'est pas transmissible par les acariens.

Key words: brome streak mosaic virus / Agropyron mosaic virus / cocksfoot streak virus / coat protein / classification of Potyviridae

Mots clés : virus de la mosaïque striée du brome / virus de la mosaïque du chiendent / virus de la striure du dactyle / protéine capside / classification des Potyviridae