Agronomie 15 (1995) 447-452
DOI: 10.1051/agro:19950711

Sequence of the 3'-part of the RNA of ryegrass mosaic virus, a potyvirus

J. Schubert^a, F. Rabenstein^b and E. Proll<sup>b

a</sup>  Federal Centre of Breeding Research on Cultivated Plants, Institute for Resistance Research
^b  Federal Centre of Breeding Research on Cultivated Plants, Institute for Pathogen Diagnostics, PO Box 1505, D-06435 Aschersleben, Germany

Abstract - The sequence of the first 2 772 nucleotides upstream from the 3'-end was identified a Danish isolate of ryegrass mosaic (RgMV) considered till now to belong to Rymovirus genus. Comparisons of the deduced amino acid sequences for the coat protein (cp) and nuclear inclusion protein (Nib) with those of other potyviruses revealed a high degree of homology with viruses of the genus Potyvirus and only weak homologies with another rymovirus, wheat streak mosaic potyvirus. The putative proteolytic cleavage site Nlb/cp exhibits a previously undescribed amino acid motif. The classification of RgMV should be reviewed.

Résumé - Séquence de la partie 3' du RNA du virus de la mosaïque du ray-grass, un potyvirus. Nous avons déterminé la séquence de 2 772 nucléotides de la portion terminale 3' d'un isolat danois du virus de la mosaïque du ray-grass (RgMV) considéré jusque là comme appartenant aux rymovirus. Les comparaisons des séquences des acides aminés de la protéine capside (cp) et de la protéine d'inclusion nucléaire (Nlb) avec des potyvirus révèlent des homologies fortes avec les virus de genre Potyvirus et seulement une faible homologie avec le virus de la mosaïque striée du blé, un autre rymovirus. Le site putatif de clivage protéolytique de la Nlblcp montre la présence de motifs acides aminés non décrits jusque là. La classification du RgMV doit être modifiée.

Key words: ryegrass mosaic virus / potyvirus / sequence / coat protein

Mots clés : virus de la mosaïque du ray-grass / potyvirus / séquence / protein capside